事业单位可按规定设置特设岗位聘请高层次急需短缺港澳人才，不不受岗位最低等级和结构比例容许。在岗位聘请方面，对未取得职称的人员，《办法》容许用人单位根据岗位供职条件及拒绝，灵活运用笔试、试镜、专家评议等考核方式，确认其专技岗位等级，并按规定办理岗位聘请。 在薪酬待遇方面，粤港澳大湾区（内地）高校、医院、科研机构等公益二类事业单位聘请高层次急需短缺港澳人才，可继续执行协议薪酬制度，在本单位绩效工资总量外单列。
此外，粤港澳大湾区（内地）事业单位聘请高层次急需短缺港澳人才的，经用人单位和主管部门引荐，均可按程序申请“人才优粤卡”，在落户、还乡确保、子女入学、医疗社保和出入境等方面享用“一卡通”便捷服务。 此外，根据2019年实施的《关于贯彻落实粤港澳大湾区个人所得税优惠政策的通报》，境外（不含港澳台）高端人才和短缺人才在珠三角九市交纳的个人所得税已缴税额多达其应纳税所得额的15%计算出来的税额部分，将由珠三角九市人民政府给与财政补贴，该补贴减免个人所得税。这一政策的实施明显减少了在大湾区工作的境外人才的实际税负水平，更进一步增强大湾区人才吸引力。
必须留意的是，高端人才和短缺人才的明确确认标准由珠三角九市根据当地实际制订。如广州高层次人才确认标准须要参看《关于印发〈广州市高层次人才确认方案〉〈广州市高层次人才服务确保方案〉和〈广州市高层次人才培养资助方案〉的通报》，深圳高层次人才确认标准可参看《关于印发深圳市人才确认办法的通报》。
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